systemity: (Default)
[personal profile] systemity
Ученые американского аэрокосмического агентства NASA рассказали миру о сенсационном открытии, которое ведет к пересмотру самого понятия "жизни", "живого организма". Речь идет о найденной на дне соленого озера бактерии, для которой естественной средой обитания является ядовитая мышьячная среда.

Однако в Институте медико-биологических исследований (ИМБП) Российской академии наук называли представленное NASA открытие "очередным мыльным пузырем" и "надуманной сенсацией". "Я к заявлению NASA отношусь так, что это ни на чем не основывающееся преждевременное заключение. Никакого инопланетного характера в этой бактерии нет", - заявила "Интерфаксу" в пятницу заведующая лабораторией ИМБП Наталья Новикова.

"На Земле существуют самые разные бактерии, которые могут расти и развиваться в самых экстремальных условиях. Могут и цианистый калий утилизировать. Они разные, усваивают разные вещества. До сих пор существуют тысячи неоткрытых видов. А это всего лишь открытие нового вида бактерий", - считает она.

Глава научной лаборатории напомнила, что бактерии могут существовать на водных контурах ядерного реактора, где высокий уровень радиации, при значительных минусовых температурах в Антарктиде, по условиям близким к тем, что существуют на Марсе.

Она также напомнила об одной из предыдущих "сенсаций" NASA, когда в 1970-х годах американские ученые обнаружили на возвращаемой капсуле "Аполлона", вернувшегося с Луны, живую бактерию. В итоге оказалось, что это земной микроорганизм.

Странная в России наука, если заведующая лабораторией ни хрена не поняла. Не поняла, что бактерии, существующие в водных контурах ядерного реактора, при значительных минусовых температурах, утилизирующие цианистый калий состоят из тех же элементов ДНК, что и человек. 

Date: 2010-12-04 08:01 am (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
"Если в определенной нуклеотидной последовательности фосфор замещён на мышьяк"
В чьей нуклеотидной последовательности? Бактерии из изестного семейства. Вот именно. О чём "дура" и говорит.

Date: 2010-12-04 08:18 am (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
"Дура" вместе с Вами, дорогой полуучёный, не понимает, что не может быть полупустого или полуполного. Небольшое замещение фосфора на мышьяк приводит к смерти организма. Почитайте Флобера. Кроме того, переход на мышьяк должен привести к целому ряду компенсаторных механизмов, связанных с метаболизмом серы и селена. Бактерии нельзя приучить к мышьяку, как пишут авторы открытия. Просто в осадке было небольшое количество бактерий с полным замещением фосфора на мышьяк, которые при пересеве всё более и более отделялись от "фосфорных" аналогов. Мышьяково-фосфорных форм не может быть просто потому, что быть не может. А отсюда - множество очень важных следствий, которые мне с Вами обсуждать не интересно в том числе и потому, что у нас второй час ночи пошёл.

Date: 2010-12-04 02:57 pm (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
"переход на мышьяк должен привести к целому ряду компенсаторных механизмов, связанных с метаболизмом серы и селена" Почему это не може произойти постепенно? Но это к слову.
А главное - кАк Вы объясняете появление мышьяковых бактерий? Одним скачком из фосфорных, типа бог из машины? Или откуда иначе у них знакомая последовательность нуклеотидов?

"Небольшое замещение фосфора на мышьяк приводит к смерти организма. "
Ой, что-то у меня закралось подозрение, что тут речь о том, чтобы взять некоторый организм и произвести в нём оное небольшое замещение.

Date: 2010-12-04 06:50 pm (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Видите ли, в чём дело. Я могу заблуждаться. Если я в этом смогу убедиться, то, во-первых, в этом признаюсь, а, во-вторых, извинюсь. Но я высказываю своё личное мнение, которое с большой вероятностью будет отличаться от мнения другого человека, обладающего индивидуальным взглядом на вещи. Реакция же тётки, которуя я назвал дурой, это - реакция типичного советского чиновника от науки. Хорошо: мыльный пузырь, так мыльный пузырь. Но даже мыльные пузыри непохожи друг на друга. Тётка же в своей реакции на новость не сказала ничего, что бы свидетельствовало о том, что у неё есть мнение по этому в общем-то нетривиальному поводу. Я уже более 17 лет вдали от страны, где человек - человеку друг, товарищ и брат. Но, как услышу знакомые обороты, начинает тошнить и хочется громко сказать: "Кишен тухес!" или "Кушен тохэс!" (как кому нравится). Я только что приехал. Через пол часа я отвечу на Ваши упрёки и подозрения.

Date: 2010-12-04 08:08 pm (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Вы же не можете одновременно есть суп и чистить зубы. Это, как дорожный знак, который одновременно показывает налево, направо и вперёд. В метаболизме нет независимых процессов, всё встроено в общую систему. Хотя мышьяк и является близким родственником фосфора, но ферменты, работающие на фосфорное соединение, не смогут делать то же самое, с арсеновым соединением. А даже малейшее изменение активности должно нарушить всю цепь согласованных процессов. Это - общие соображения, никто, насколько я знаю, не догадывался синтезировать пиридиновые нуклеотиды на мышьяке, аденозил триарсенат и т.д. и пробовать эти соединения на процессах ин витро.

Каждая более или менее выраженная таксономическая структура имеет, как правило, некое обобщающее свойство и свойство, связанное с той или иной экологической нишей обитания. Например, все Mycobacterium имеют миколовые кислоты, но длина алкильной цепи миколовых кислот отличается. Сапрофитные почвенные микобактерии имеют близкие значения длин, в то время, как микобактерии проказы, микобактерии бычьего и человечьего туберкулёза имеют свою общность и отличаются от миколовых кислот сапрофитных микобактерий. Т.е. экологическая ниша, а в особенности это касается экстремофилов, в существенной степени формирует физиологическое, биохимическое, соответственно, таксономическое сходство бактерий.

Я разработал теорию, согласно которой то, что мы называем жизнью, зародилось до появления нуклеиновых кислот, белков, желтков и пр. Матрицей будущей жизни послужила способность простейшей самоорганизующейся системы аккумулировать энергию внешней среды в виде первичного макроэрга - окиси магния. АТФ, как универсальная энергетическая валюта всего живого, явилась эволюционным усовершенствованием окиси магния. Окись магния включена в активную АТФ между вторым и третьим фосфатом, а АТФ-аза является эволюционным усовершенствованием механизма спонтанного синтеза окиси магния.

Как известно, окись магния взаимодействует с водой с возвратом в ион магния. В соответствии с высказанным мною мнением первым шагом на пути от окиси магния к АТФ, т.е. к защите окиси магния от гидролиза явилось взаимодействие первой с фосфатами, с пирофосфатом и полифосфатами. В дальнейшем для ограничения длины полифосфатов использовался аденозин.

Озеро Моно образовалось 750 тысяч лет назад и постоянно усыхает. Если в воде озера присутствовали одновременно значительные количества и фосфата, и арсената, то эволюция могла пойти параллельно: взаимодействие окиси магния с пирофосфатом и пироарсенатом, полифосфатами и полиарсенатами. В одинаковых условиях таким образом мог сформироваться, как фосфатный вариант, так и арсенатный вариант бактерии. Идентичные условия существования и сходство физико-химических свойств арсения и фосфора могли привести, соответственно, к возникновению параллельных видов.

Вопрос этот чрезвычайно интересен. У меня сейчас не очень много времени, но я начну следить за деталями публикаций об этом феномене.

Date: 2010-12-05 07:24 am (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
"никто, насколько я знаю, не догадывался синтезировать пиридиновые нуклеотиды на мышьяке, аденозил триарсенат и т.д. и пробовать эти соединения на процессах ин витро."
Скорее всего, это технически невозможно. Сами-то эти соединения могут выживать в водной среде достаточно времени для эксперимента?
Если всё-таки возможно - то зря, что не догадались, хотя насчёт вероятных результатов я Вашего мнения не оспариваю, просто тут белое пятно, не особо заманчивое, но бросающееся в глаза - надо закрасить и, скорее всего, забыть.
Да, а в качестве матрицы для полимераз, используемых при секвенировании, мышьяковая ДНК всё-таки годится?


"даже мыльные пузыри непохожи друг на друга. Тётка же в своей реакции на новость не сказала ничего, что бы свидетельствовало о том, что у неё есть мнение по этому в общем-то нетривиальному поводу."
Ну пусть не разбирается она в мышьяке. А рассуждала логично: замещение - ну бывает. Штука интересная и неожиданная, но ничего инопланетянского в этом нет.


Длина цепи, возможно, имеет функциональное значение (температура?). Но (очень слабым) аналогом Вашей версии было бы независимое появление миколовых кислот у эукариот или архей. Совпадение же, в случае "параллельной жизни", нуклеотидных последовательностей, используемых - при сегодняшних-то методах - для классификации, куда менее вероятно, а их функциональность существует лишь в контексте уже сложившейся жизни. Предположим, что мы имеем достоверно "параллельную жизнь" с теми же нуклеотидами. Случись при этом мало-мальская корреляция последовательностей (но достоверно не шумовая), это было бы сенсацией, потрясающей основы науки.

"Матрицей будущей жизни послужила способность простейшей самоорганизующейся системы аккумулировать энергию внешней среды в виде первичного макроэрга - окиси магния."
Матрица - это вообще-то насчёт информации, а не энергии. Если бы мы знали, как выглядели (химически) первые репликаторы - только тогда и имел бы смысл вопрос, откуда бралась энергия.

Date: 2010-12-05 08:17 am (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
"Скорее всего, это технически невозможно. Сами-то эти соединения могут выживать в водной среде достаточно времени для эксперимента?" Это очень устойчивые соединения.

"Ну пусть не разбирается она в мышьяке. А рассуждала логично: замещение - ну бывает". Не бывает, потому и дура. Инопланетянство не имеет к этому отношения.

Миколовые кислоты с различной длиной боковой цепи встречаются лишь у микобактерий, нокардий или коринебактерий. При чём здесь археи и эукариоты???!!! Длина боковой цепи не имеет никакого отношения к температуре.

Фосфорный и мышьяковый вариант могут быть близкими видами, но иметь отличные последовательности ДНК.

Здесь как раз и идёт речь о матрице, поскольку в процессе первичной аккумуляции энергетических шумов и была заключена вся информация о будущих живых существах. Вопреки идиотской лотерейной логике большинства исследователей в области origin of life никакого метаболизма вот так на голом месте возникнут не могло. Я не говорю уже о процессе синтеза АТФ и о совсем уж идиотских сказках про РНК-мир. Самопроизвольно мог возникнуть только процесс аккумуляции энергии, отсюда - АТФ, от АТФ - метаболизм. Далее - везде.

Date: 2010-12-04 03:31 pm (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
Почему Screened comment? У меня-то мой коммент должен быть виден. Я залогинен, что видно и в данном окне.

Date: 2010-12-04 06:37 pm (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Я не понимаю, что Вас беспокоит. Все Ваши комментарии доступны.

Date: 2010-12-05 07:15 am (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
Они были недоступны посторонним (что нормально), но в тот раз были недоступны и мне (что ненормально).

Date: 2010-12-05 07:19 am (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Я не делал ничего, ничего не менял. М.б. это какие-то шутки от администрации LJ?

Profile

systemity: (Default)
systemity

February 2023

S M T W T F S
   12 3 4
567891011
12131415161718
19202122232425
262728    

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Mar. 14th, 2026 06:20 am
Powered by Dreamwidth Studios