systemity: (роза красная морда большая)
View on Lipids of Microorganisms from the Standpoint of Prebiotic and Biological Evolution. PART III

Leonid Andreev


Part II: https://systemity.livejournal.com/4661607.html

Original paper "View on Lipids of Microorganisms from the Standpoint of Prebiotic and Biological Evolution" published in: Voprosy Evolutsii Bakterij (Evolution of Bacteria), USSR Academy of Sciences, Center for Biological Research, Institute of Biochemistry and Physiology of Microorganisms, Pushchino, 1984, pp. 93-119 (https://www.dropbox.com/s/tx666ilga018yvt/OriginOfLifeRus.pdf).
This translation was first published in 2004 on the company website of Equicom, Inc. which is no longer online.

Macromolecular chronometry

It would seem that this logical deadlock could be resolved by comprehensive investigation of regularities in the evolution of those macromolecules which perform same functions in evolutionarily distant contemporary organisms. With the fundamental capabilities created by molecular biology methods, it is possible now not only to investigate evolutionary relations between various organisms but also to estimate a relative time point of their divergence, i.e. evolutionary distances. The idea of the “molecular evolutionary clock” was first proposed by Zuckerkandl and Pauling [34] in 1965. It is based on the fact of existence of a great variety of macromolecules that, having different sequences of monomers, are capable of performing same functions. Consequently, mutational changes in proteins and nucleic acids can provide a measure of the evolution time. Woese [33] recently made a detailed analysis of the results obtained with the use of the molecular chronometry method and discussed the ways for further improvement of the method and overcoming its limitations.

For instance, one of the major limitations of the method is caused by the fact that the relative speed of homologous macromolecular clocks can be different in different organisms. Also, in bacteria, an intensive interspecies transfer of genes with totally different evolutionary backgrounds may contribute into different genealogy of macromolecules of one and the same organism. Both of those limitations can be resolved in one or another way. For instance, it was shown that the use of two independent molecular clocks – cytochrome c and ribosomal RNA – provided consistent data on purple synthesizing bacteria [22]. Phylogenetic structures based on molecular chronometry studies [25, 29] attract a lot of interest in biologists of various areas of specialization, and there is a hope that this method can help to develop objective criteria for evaluation of evolutionary relations between various groups of organisms. Nonetheless, the areas in which molecular chronometry is either ineffective or insufficiently effective include, first and foremost, the issues of prebiotic evolution, emergence of life and the functioning of early life forms. It is also important  to realize that the discovery of the paths of evolution of life on Earth is not an answer to the question about the reasons for the choice of those paths.


Read more... )


systemity: (роза красная морда большая)
View on Lipids of Microorganisms from the Standpoint of Prebiotic and Biological Evolution. PART II

Leonid Andreev


Part III: https://systemity.livejournal.com/4661963.html
Part I: https://systemity.livejournal.com/4661364.html


Original paper "View on Lipids of Microorganisms from the Standpoint of Prebiotic and Biological Evolution" published in: Voprosy Evolutsii Bakterij (Evolution of Bacteria), USSR Academy of Sciences, Center for Biological Research, Institute of Biochemistry and Physiology of Microorganisms, Pushchino, 1984, pp. 93-119 (https://www.dropbox.com/s/tx666ilga018yvt/OriginOfLifeRus.pdf).
This translation was first published in 2004 on the company website of Equicom, Inc. which is no longer online.

Enzymes and coenzymes

The membrane system of prokaryotic organisms lacks an expressed anatomic compartmentalization of membrane enzymatic processes, which is the key difference between eukaryotic and prokaryotic organisms. The prokaryotic type of membrane system organization causes tremendous difficulties for the cellular level regulation of the membrane enzymatic processes which involve same coenzymes. Strangely, this peculiarity of bacteria has been getting very little attention [3]. Based on molecular weights of the most widely distributed coenzymes that supply membrane-immobilized enzymes of small reacting molecules, such as protons, C1- and C2- compounds, etc., it can be easily established, by the Einstein diffusion equation, that  at physiological temperatures, those enzymes cover within a second the distances that several times exceed the length of a bacterial cell. Knowing that, it is hard to understand, for instance, the secrets of coordination of the activity of dozens of types of enzymes, whose functioning requires  pyridine nucleotide carriers in specific concentrations strictly determined by a current physiological state of the cells.

Read more... )


systemity: (роза красная морда большая)
View on Lipids of Microorganisms from the Standpoint of Prebiotic and Biological Evolution* PART I

Leonid Andreev


Part II: https://systemity.livejournal.com/4661607.html

Original paper "View on Lipids of Microorganisms from the Standpoint of Prebiotic and Biological Evolution" published in: Voprosy Evolutsii Bakterij (Evolution of Bacteria), USSR Academy of Sciences, Center for Biological Research, Institute of Biochemistry and Physiology of Microorganisms, Pushchino, 1984, pp. 93-119 (https://www.dropbox.com/s/tx666ilga018yvt/OriginOfLifeRus.pdf).
This translation was first published in 2004 on the company website of Equicom, Inc. which is no longer online.

Contents:

• Specificity of lipids as an object of molecular biological studies
• Cellular level of lipid studies
• The concept of polylipids
• Interaction between polylipids and proteins
• Role of fatty acid residues
• Enzymes and coenzymes
• Principle of quasi-equilibrium of biosynthesis of bacterial lipids
• On the origin of life on Earth
• Macromolecular chronometry
• Molecular model of a protobiont
• Conclusions


Specificity of lipids as an object of molecular biological studies

Modern molecular biology incorporates a number of research areas dealing with substances and processes of general biological significance. Those areas of research, stimulated and inspired by the efficacy of the currently available physico-chemical methods, considerably differ in methodologies and – what is especially important – due to their specific developmental backgrounds, they have different levels of relationship with cellular biology.

When that relationship is lost or is not yet strong enough, it is often understood as an indication that some of the problems of physical chemistry of bioorganic molecules may be as broad and complex as the issues encountered with in the study of the functioning of live cells. This concerns particularly investigations of biological macromolecules that are functionally active outside the cells that synthesize them. That kind of misconception is not accidental. The awareness of the fact that, despite a theoretically possible large variety of structural and functional organizations of biopolymers, the Nature has only a limited number of their variants, impedes the advance of researchers in physics and chemistry of the functionality of such molecules, as it makes them divert to working on problems which require qualitatively different approaches and expertise and force them to study such properties of organisms which require deep empirical knowledge. This is a psychological reason that explains why many molecular biologists at least sympathize with, if not fully concede to, the thesis that the notion of ‘cell’ “has become a brake on the progress toward the understanding of live structures at the molecular level” and that “one may stop treating the cell as a biological unit but consider it as merely one of the stages of a complex chain of transformations” [16]*.

In practice, such views may seem to be justified as the attempts not to limit oneself to the “barest necessities” of evolutionary biology and “biological purposefulness” and, instead, consider the cell to be “merely one of the stages of a complex chain of transformations” may often be helpful in extensive fundamental investigations in molecular biology, leading to innovative approaches to various aspects of the functioning, systematics and evolution of live organisms. A classical example of such fundamental works in molecular biology that already by now have significantly contributed into the progress in evolutionary biology, is the method of macromolecular chronometry developed a quarter of a century ago [34] based on physico-chemical, rather than biological, logic.

_________________________________________________________
* Rendition is based on the Russian edition of the source book.


Read more... )






systemity: (роза красная морда большая)
Origin of Life: Molecular Model of a Protobiont

Leonid Andreev


Original paper "View on Lipids of Microorganisms from the Standpoint of Prebiotic and Biological Evolution" published in: Voprosy Evolutsii Bakterij (Evolution of Bacteria), USSR Academy of Sciences, Center for Biological Research, Institute of Biochemistry and Physiology of Microorganisms, Pushchino, 1984, pp. 93-119 (https://www.dropbox.com/s/tx666ilga018yvt/OriginOfLifeRus.pdf).

This paper was first published in 2004 on the company website of Equicom, Inc. which is no longer online

Origin of life on Earth has yet to find its own paradigm, and this fact overshadows the capabilities of contemporary science, although in reality it is well equipped for solving this problem. It is generally believed that the main cause of this predicament is the lack of material evidence that could provide a clue about the events that some four billion years ago had the life get started amidst the inorganic matter. Proceeding from that premise is a methodological deadlock: how to define the borderline between the non-life and the start of life – i.e. at what point in retrospect does the trail of evidence stop? If we take the most remarkable biological property inherent in all contemporary forms of life – reproduction – and try to trace it back so as to pinpoint its inception in the earliest forms of the living matter, we have to start with the emergence of the replication mechanism. But first there had to emerge something that was worth of replication.

Due to the lack of agreement on what can be qualified as a primordial sign of life, researchers in the origin of life have undertaken investigations on all probable and improbable leads, including anything of at least remote relevance to biosynthesis of molecules involved in contemporary organisms: synthesis of amino acids from simple  inorganic molecules, catalytic properties of clay minerals, spontaneous formation of membrane-like structures, etc., up to ideas about spontaneously emerging DNA and RNA, which, in the opinion of the idea’s authors, should have resulted in miraculous appearance of biologically purposeful structures. All of such theories are based on presumption of spontaneity of transformation of nonliving matter into living matter. Essentially, all things considered, the difference between evolutionism and creationism is nothing but the extent of passion about the object of faith; and, on the scale of integrity and logic consistency, the science-wealthy evolutionism married to mysticism stands lower than creationism.

Twenty years ago, I published a paper explaining my hypothesis of the origin of life on Earth and presenting a molecular model of a protobiont, a hypothetical earliest ancestor of the biological cell. The paper was published in a collection of articles on evolution of bacteria, by the Center for Biological Research in Pushchino of the then USSR Academy of Sciences. Recently, having stumbled upon a few research papers dealing with the problem of the origin of life on Earth, I went on to see what has changed in general in this field within the past twenty years and have found out that there was nothing new. This has been a good stimulus for me to finally get to translate my 1984 paper into English and post it on this web site. Back then, I had every reason to muse on the role of lipids in the functioning of live organisms. Due to my years-long work in express
identification of bacteria, I had had an opportunity to investigate the fatty acid (and occasionally phospholipid) composition of over 33,000 strains of bacteria.


Read more... )



systemity: (роза красная морда большая)
В аннотации к своей статье "XXI век: что такое жизнь с точки зрения физики" (Успехи физических наук, 2010, том 180, номер 4, стр. 337–369) бывший директор Института теоретической и экспериментальной биофизики РАН член-корреспондент РАН Г.Р. Иваницкий пишет: "Рассмотрена эволюция биофизической парадигмы в течение 65-ти лет после выхода книги Э. Шрёдингера «Что такое жизнь с точки зрения физики?» (1944 г.). На основе успехов молекулярной генетики показано, что все признаки, которыми характеризуются живые системы, встречаются в системах неживой природы (Л.А. - эта эта чрезвычайно "глубокая" мысль выделена мною). Рассмотрены десять логико-физических парадоксов, которые позволяют дать определение жизни в терминах пространственно-временнóй иерархии структур и комбинаторной вероятностной логики. Жизнь с точки зрения физики можно определить как результат процесса игры взаимодействий материи, в которой одна её часть приобрела свойство запоминать вероятности появления удач и неудач в предыдущих раундах этой игры, повышая тем самым свой шанс на существование в последующих раундах. Эту часть материи сегодня называют живой материей." Этот жанр художественной литературы применительно к научным темам возник не из собственных изысканий Генриха Романовича, а вытекает из почти столетних безуспешных попыток объяснить, чем биология фундаментально отличается от химии и физики.

Наверняка, будучи многолетним директором Института биофизики АН СССР, Иваницкий неоднократно задумывался над этим фундаментальным вопросом академической науки, с которым непосредственно связан чисто профессиональный вопрос "является ли биофизика наукой?". Над этим вопросом безуспешно задумывались и десятки выдающихся деятелей науки, включая нобелевских лауреатов. Ответ на этот фундаментальный вопрос фундаментально прост. Его даже нет необходимости обосновывать и доказывать, он включает в себя всего несколько слов, что полностью соответствует древнеримской поговорке "Argumenta ponderantur, non numerantur (Сила аргументов не в числе, а в их весомости)". Но всё по порядку.


Read more... )




systemity: (роза красная морда большая)
Массовые помешательства происходят не только в религии, социальной жизни, экономике и политике, но и в науке. В фундаменте всех видов массового помешательства лежит отсутствие конкретного знания, большое желание этим знанием владеть или изображать владением этим знанием и отсюда - самообман, построенный на вере в любую труху, хотя бы косвенно напоминающую столь желаемое знание. Древние истово верили в то, что на небесах сидит кто-то с большой бородой, который издаёт гром и молнии, верили в то, что Земля покоится на трёх китах, миллионы и ныне веруют в то, что когда-то на свет божий явится мессия, который наведёт порядок на Земле, отметелит всех, кто нарушал закон, мораль и правила общежития. Где мессия ошивается тысячелетия, никто не знает. Может быть он прячется в каком-то атомном ядре в виде бозона Хиггса, может быть покоится в каком-то невскрытом саркофаге. Экстраординарных идей на этот счёт можно придумать много, но идеи и гипотезы верующим вообще-то абсолютно не нужны. Они согласны веровать бесплатно, не используя знания, логику и даже просто здравый смысл. А в науке идеи и гипотезы обязательны. Верование без идей и гипотез в науке уже сотни лет, как не считается допустимым.

Научные идеи и гипотезы бывают двух сортов. Одни из них конструктивны и ведут к расширению знания. Другие - подпадают под определение "а ну-ка докажи, что это не бред!". К этому второму сорту гипотез относится вышеупомянутый мешиах-махди, инопланетяне, практически все гипотезы по поводу происхождения жизни на Земле, начиная от гипотезы шести дней творения и кончая не менее идиотской гипотезой происхождения жизни из нуклеиновых кислот. Если гипотеза о шести днях творения внедрялась в народное сознание практически бесплатно или за деньги верующих, то на гомерически тупую идею о происхождении жизни на Земле из нуклеиновых кислот были потрачены миллиарды долларов для проведения "исследований" с помощью самой передовой научно-исследовательской технологии.

По идее сообразительному школьнику может легко придти в голову мысль о том, что нуклеиновые кислоты не бывают без белков, белки не бывают без нуклеиновых кислот, а самое главное - ничего в биологии не бывает без доставки энергии к реагирующим молекулам, так сказать, персонально. Биосинтез как основа жизни невозможен без такой индивидуальной доставки энергии к реагирующим молекулам. Если бы не этот способ доставки энергии, то продукты биосинтеза, а их синтезируется в клетке огромное количество одновременно, превратились бы в смолу или, как говорили у нас в Баку, где я родился и учился, превратились бы в "кишмиш-лябляба". Хорошо известно, что роль такого индивидуально нацеленного поставщика энергии к реагирующим молекулам для всех проявлений жизни от бактерий до слонов играет аденозинтрифосфорная кислота или АТФ. Но, как говорится в известном анекдоте, "где дом, а где Кура?!". Где нуклеионовые кислоты, а где аденозинтрифосфорная кислота, которая должна была бы по идее самопроизвольно образовываться тогда, когда ещё ничего самопроизвольно не образовывалось?

Лысенковец Опарин придумал гипотезу возникновения жизни из капелек бульона, возникшего в океане предбиологической безатмосферной Земли, который мог образоваться только в голове человека, слабо разбирающегося в химии и физике, не говоря уже о биологии. А несколько лет тому назад на тожественном заседании в российской академии наук торжественно отмечали какую-то годовщину Опарина. Выступали академик Спирин, член-корреспондент Кулаев с дифирамбами в честь этого первооткрывателя наиболее цитируемого бреда. Сам академик Спирин, будучи директором Института белка АН СССР, в течение многих лет занимался проблемой возникновения жизни из нуклеиновых кислот.

Всё это я написал вот почему. Только что на глаза мне попалась очередная статья об обнаружении воды на Луне (https://cursorinfo.co.il/all-news/v-nasa-nashli-led-na-lune-teper-navernyaka/). На гугле можно встретить многие сотни тысяч статей об обнаружении воды на Марсе (например, https://www.7kanal.co.il/News/News.aspx/202994) и других космических объектах. На эти поиски воды в космосе в течение десятилетий тратятся огромные средства. Имеется ввиду идея о том, что вода как-то связана с жизнью, имеет какое-то отношение к возникновению жизни. Какое именно - никто не знает. Никто! На этот счёт нет никаких нормальных гипотез. Но ищут в экстазе водопомешательства...

На самом же деле вода лежит в основе жизни. 34 года тому назад я опубликовал статью, в которой обосновал это положение (https://systemity.livejournal.com/4661364.html, https://systemity.livejournal.com/4659992.html, https://www.dropbox.com/s/tx666ilga018yvt/OriginOfLifeRus.pdf, https://systemity.livejournal.com/1237317.html). Смысл его сводится к тому, что в самоорганизовавшейся молекулярной системе, работающей на основе теоретически обоснованного мною варианта кето-енольной таутомерии, происходило образование из иона магния молекулы окиси магния, явившейся и являющейся во всех современных биологических организмах предшественником аденозинтрифосфорной кислоты. Самоорганизовавшаяся первичная молекулярная система состояла из липидов. Суммарная реакция такова: ион магния + молекула воды = окись магния и два протона. Гипотезу о роли воды, разработанную мною 40 лет назад, мне удалось опубликовать в сборнике научных работ биологического центра академии наук в г. Пущино-на Оке. Удалось опубликовать лишь потому, что никто ничего не понял.

Будучи автором двух сотен научных публикаций и полусотни изобретений, я даже не пытался опубликовать подробную статью на этот счёт по очень простой причине: ни один журнал эту статью бы не принял к печати. Достаточно сказать, что одной публикации такой статьи было бы достаточно для закрытия очень популярного журнала "Astrobiology", на прекращение трат огромных средств на поиски воды в космосе, поскольку моя гипотеза объясняет то, что жизнь могла произойти только из одной единственной клетки и вероятность этого процесса равна абсолютному нулю. Это вам не массовое вылупление клеток из капелек бульона и не трудные роды жизни из нуклеиновой кислоты, самопроизвольное образование которой вообще никакой вероятности не имеет.





systemity: (Default)
Учёные сообщили, что осьминог - существо инопланетное


Исследование эволюции осьминогов приводит к выводу, что она произошла слишком быстро, чтобы начаться, на Земле. Опубликованные в журнале «Прогресс в биофизике и молекулярной биологии», 33 ученых объявили беспозвоночного морского обитателя пришельцем, чьи яйца высадились из космоса.

Но ученые продолжают делать еще более экстраординарные претензии в отношении осьминогов, которые, похоже, быстро эволюционировали на Земле примерно 270 миллионов лет назад, спустя 250 миллионов лет после взрыва кембрия.

   
В статье говорится: «Геном Осьминога показывает ошеломляющий уровень сложности с 33 000 белок-кодирующих генов больше, чем в Homo sapiens.

   
«Его большой мозг и сложная нервная система, похожие на камеру глаза, гибкое тело, мгновенное изменение внешнего вида, благодаря способности переключаться по цвету и форме - вот лишь некоторые из поразительных особенностей, которые внезапно появляются на эволюционной сцене.

   
«Трансформирующие гены, ведущие от консенсусного предка Наутилуса к обычным каракатицам, к кальмару, нелегко найти в какой-либо ранее существовавшей форме жизни, тогда можно предположить, что они, похоже, заимствованы из далекого будущего «В терминах земной эволюции или более реалистично из космоса в целом.

   
«Одним из правдоподобных объяснений, на наш взгляд, является то, что новые гены, вероятно, являются новым внеземным импортом на Землю - наиболее правдоподобно, как уже когерентная группа действующих генов внутри (скажем) криоконсервированных и защищенных матрицами оплодотворенных яиц Octopus.

   
«Таким образом, вероятность того, что криоконсервированные кальмары и / или яйца осьминога, прибывшие в ледяных болидах несколько сотен миллионов лет назад, не должны быть обесценены, поскольку это было бы экономным космическим объяснением внезапного появления Осьминога на Земле около 270 миллионов лет назад».





Бедные молекулярно-биологические идиоты, которые пару десятилетий носились с априорно идиотской идеей происхождения жизни из нуклеиновый кислот, с горя сошли с ума: то, что они не в состоянии были, несмотря на затраченные на пустой бред миллиарды долларов, доказать, они решили теперь окончательно свалить на Космос, на который можно всё свалить из-за его недоступности. Он всё вытерпит. А ведь много лет тому назад было совершенно ясно, что без белков нуклеиновые кислоты - ничто, а без нуклеиновых кислот белки - ничто, а без молекулярного переносчика энергии (АТФ) и то, и другое - ничто: https://www.dropbox.com/s/tx666ilga018yvt/OriginOfLifeRus.pdf, https://systemity.livejournal.com/4661364.html, http://www.proza.ru/2016/03/06/2564



systemity: (роза красная морда большая)
Относительно давно известно, что мышление имеет, как минимум, двойственную природу, включающую гармоничное взаимодействие ассоциативного и логического способов осмысления наблюдаемых объектов и явлений. Ассоциация или связь - это то, что возникает в процессе такого способа мышления, в результате которого появление одного элемента в определенных условиях вызывает в сознании образ другого, связанного с ним. Эта связь легко возникает и закрепляется в памяти между отдельными событиями, отдельными людьми, предметами, фактами, явлениями. Ассоциативное мышление представляет собой исключительно важную составляющую разума человека по переработке информации, позволяющую ему выделять общие признаки вещей, т.е. обобщать, не проводя логического анализа. Считается, что ассоциативное мышление у женщин развито сильнее, чем у мужчин, поскольку оно несравненно быстрее логического и потому, что в силу своей природы для женщины конкретное важнее широких обобщений, наблюдение за своим ребёнком намного важнее наблюдений за всеми детьми планеты.

Логическое же мышление богаче и много сложнее ассоциативного. Это - совершение мыслительного процесса с помощью категорий, которых нет в природе, которые по этой причине нельзя скопировать, запомнить. Оно  позволяет человеку моделировать отношения не только между реальными объектами, но также и между абстрактными и образными представлениями, которые создавало само мышление в процессе становления мыслительных способностей человека и которое позволяет ему находить непротиворечивые связи между феноменами действительности. Иными словами, логическое мышление основано на достижении истины в процессе познания опосредованным, непротиворечивым путём. Не из чувственного опыта, не из совокупности наблюденных ассоциаций, а из знаний, полученных с помощью переработки и абстрагирования совокупности ранее наблюденного.
Read more... )


systemity: (роза красная морда большая)
Эта глава только на первый взгляд имеет далёкое отношение к заглавию книги. Нет человека, который бы не желал знать, как произошла жизнь на Земле. Кто-то из людей не расположен вникать в детали этой сложной науки, разбираться в научной терминологии, тем более оценивать здравомысленность отдельных попыток объяснить пока что никем не объяснимое. Кто-то не расположен отвлекаться на эти высокие материи, вполне удовлетворившись удобной верой в то, что Творец, которого никто не сотворял и который появился лишь в головах сотворённых им людей, создал жизнь за шесть дней творения или, как принято выражаться у современных верующих в эту безумную идею, возникшую у наших древних капитально неграмотных предков, за шесть этапов творения. Кто-то через интернет подхватил уже не библейскую, а научно-религиозную идею о сотворении жизни из конечных продуктов сотворения и эволюции жизни - нуклеиновых кислот, которую вдолбили в голову человечеству с помощью тех же средств массовой информации, с помощью которых вдолбили людям необходимость бороться с "плохим холестерином" и другими идеями столь же высокого уровня "грамотности".

На сегодняшний день ни одна из идей, высказанных за последние 100 лет по проблеме происхождения жизни на Земле, не могла быть непосредственно связана с  конкретными процессами, происходящими в живых существах, населяющих современную Землю. Распространяемые современными учёными сказки о биополимерах скопированы с процессов высших стадий эволюции живого, поэтому на самом деле являются ничем иным, как имитацией проблемы происхождения жизни на Земле. Здесь, как и в варианте шести дней-этапов божественного творения, сценарий сотворения мира потерялся в религиозной вере о том, что всё получилось самим собой, случайно.

Даже в попытке сформулировать, что такое "жизнь" наука не преуспела. Литературные изыски на эту тему не способны объяснить ни одно из конкретных проявлений жизни. А между тем существует множество явлений, имеющих самое прямое отношение к здоровью современных людей, которые могут быть объяснены только лишь с позиций механизма зарождения жизни на Земле. Ведь это - тот фундамент, который никак не может исчезнуть в процессе эволюции. А феноменальных особенностей жизненных процессов весьма немало, и если гипотезы, нацеленные на объяснение происхождения жизни на Земле не в состоянии объяснить происхождение этих феноменальных особенностей, то - грош цена таким гипотезам.

Например, изомерами называются вещества, имеющие одинаковый качественный и количественный состав атомов, но отличающиеся их расположением, а следовательно, и свойствами физическими, химическими и биохимическими. Среди изомеров встречаются т.н. энантиомеры, стереоизомеры, представляющие собой зеркальные отражения друг друга, не совмещаемые в пространстве. Свойство молекулы не совмещаться в пространстве со своим зеркальным отражением называется хиральностью от греческого слова, обозначающего руку. Классической иллюстрацией двух энантиомеров могут служить правая и левая ладони: они имеют одинаковое строение, но различную пространственную ориентацию. На рисунке энантиоморфные изомеры альфа-аминокислот сравниваются с двумя руками человека:






Ниже на рисунке, взятом из статьи (https://arxiv.org/pdf/1606.07483.pdf), приведены два стереоизомера простой молекулы - окиси пропилена, которая используется при производстве полиуретана. Эти два энантиомера  по-разному вращают плоскость поляризации света. Левовращающий энантиомер обозначается индесом S- или L-, правовращающий - индексом R- или D-. Эквимолярная смесь двух энантомеров называется рацематом. Для обозначения рацематов используются приставки RS либо SR. В химических реакциях, приводящих к образованию нового стереоцентра в молекуле в отсутствие стереодифференцирующих факторов, продукты получаются в рацемическом виде, т.е. эквимолярной смеси лево- и правовращающих рацематов. Большинство аминокислот содержат один хиральный центр и имеют два стереоизомера. Аминокислоты изолейцин, треонин, гидроксипролин, 5-гидроксилизин и цистин содержат два хиральных центра и имеют (кроме цистина) 4 стереоизомера, из которых только один встречается в составе белков. Так, из 4-х стереоизомеров треонина в природе встречается только (2S,3R)-2-амино-3-гидроксибутановая кислота.




Далее я все перечисляемые ниже феноменальные особенности современной биохимии буду обозначать знаком NB, что является производным от латинского "Nota bene" - "Обратить внимание!". В конце этой главы я объясню, каким образом эти отмеченные мною позиции объясняются с точки зрения сценария происхождения жизни на Земле, который я начал разрабатывать более 40 лет тому назад (https://www.dropbox.com/s/tx666ilga018yvt/OriginOfLifeRus.pdf, https://systemity.livejournal.com/4661364.html, https://systemity.livejournal.com/4661607.html, https://systemity.livejournal.com/4661963.html). В соответствие с этим сценарием жизнь на Земле началась с образования самоорганизующегося комплекса простых молекул, способного аккумулировать энергетические шумы с образованием окиси магния - предшествегнника АТФ.

Всем хорошо известно, что белки пищи, которую мы едим, состоят не из рацемических аминокислот, но... только из левовращающих аминокислот (NB I). Причём при возможном числе аминокислот, которые могли бы образовываться в природе, порядка более трёх сотен, в белках, входящих в число всех живых организмов на Земле, присутствуют только лишь два десятка аминокислот (NB II). Если бы человеку подали бы бифштекс из правовращающих аминокислот, то ферменты его организма такой бифштекс переварить бы не смогли. Ответа на вопрос, почему всего лишь два десятка только лишь левовращающих аминокислот составляет основу всех белков живых организмов Земли, современная наука не имеет даже в зачатке.

Кислород атмосферы, без которого жизнь подавляющей части биосферы Земли невозможна, возник в результате фотосинтеза, преобразующего энергию Солнца в кислород и глюкозу. Фотосинтез осуществляется с помощью микробных и растительных хлорофиллов, непременным компонентом которых является магний (NB III). Не кальций - ближайший родственник магния среди щелочноземельных элементов 2-группы Периодической системы элементов Менделеева, не стронций или бор, а только магний. Магний, а не его ближайший химический аналог является обязательным компонентом, участвующим в синтезе универсального среди живых организмов переносчика энергии аденозинтрифосфата (АТФ). Все натурально синтезированные молекулы АТФ представляю собой соединения с магнием (NB IV). Родственник магния бериллий является высокотоксичным веществом, нарушающим работу ферментов путём замещения магния. Предельно допустимая концентрация бериллия в воздухе составляет 0,001 мг/м³ (NB V). Все элементы второй группы второго периода Периодической системы, включая кальций, являются антагонистами магния.

Среди пространственной изомерии существует т.н. "цис-транс-изомерия", заключающаяся в возможности расположения заместителей по одну или по разные стороны плоскости двойной связи. Обозначения "цис" и "транс" произошли от латыни: "цис" означает "на одной стороне", а транс - "на другой стороне". На рисунке ниже в качестве примера приведены формулы цис- и транс-изомеров ненасыщенного углеводорода бутена:


                                 
           цис-2-бутен                                          транс-2-бутен


Среди жиров (липидов), которые мы потребляем в пищу, имеются ненасыщенные жиры, содержащие жирнокислотные радикалы с двойными связями. Особенно много таких ненасыщенных жиров в маслах растительного происхождения. За очень редким исключением ненасыщенные связи природных липидов имеют цис-конфигурацию (NB VI). Оказалось, что жиры, содержащие жирные кислоты транс-конфигурации, попадающие в пищу в основном из маргарина, крайне опасны для здоровья человека. Например, основной жирной кислотой оливкого масла является цис-октадеценовая - олеиновая кислота. Содержание её колеблется в интервале 55-83%, в подсолнечном масле её 30%, человеческий жир содержит 49% олеиновой кислоты и 8% другой цис-мононенасыщенной - пальмитолеиновой кислоты.

На рисунке, приведенном ниже, показано, как олеиновая кислота кардинально структурно отличается от её транс-изомера - элаидиновой жирной кислоты.
Почему именно ненасыщенные жирные кислоты цис-, а не транс-конфигурации полезны и безопасны для здоровья, науке совершенно не известно (NB VII).


                                     

         Олеиновая кислота                                                 Элаидиновая кислота


Маргарин представляет собой продукт, вырабатываемый из натуральных модифицированных растительных и животных жиров. Истории маргарина более 200 лет, он и поныне широко используется как заменитель сливочного масла в кондитерской и хлебопекарной промышленности, в кулинарии, домашней выпечке, а также употребляется непосредственно в пищу. Весь смысл разработки технологий производства маргарина заключался в замене им дорогого сливочного масла. Немецкий химик В. Норманн в 1902 году запатентовал технологию гидрогенизации жидких масел с целью получения маргарина. В 1909 году права на пользование патентом в США были выкуплены компанией "Procter and Gamble", которая через два года начала продажу жира, изготовленного из частично гидрогенизированного хлопкового масла. В те же годы гидрогенизация позволила увеличить сроки хранения китового жира - ворвани.

Производство маргарина превратилось в огромный по масштабам промышленный бизнес. С помощью сумасшедшей рекламы американцам внушали, что маргарин полезнее сливочного масла, из него готовили бутерброды на завтрак.
Маргарин стал основной частью западной диеты и в середине 20-го века обогнал по потреблению сливочное масло. В Соединенных Штатах, например, в 1930 году, средний человек ел более 8,2 кг сливочного масла в год и чуть более 0,91 кг маргарина. А к концу 20-го века средний американец потреблял около 2,3 кг масла и почти 3,6 кг маргарина.

Маргарин имеет особую рыночную ценность для тех, кто соблюдает придуманные древними еврейскими специалистами диетические законы Кашрута, почему-то запрещающие смешивание мяса и молочных продуктов. По этой причине производятся абсолютно кошерные немолочные маргарины, что удостоверяется печатью раввинов. Эти "кошерные" маргарины  используются для производства хлебобулочных изделий, которые разрешается подавать с мясными блюдами. Недостаток маргарина в 2009 году в Америке вызвал много беспокойства в сообществе придерживающихся кошерных диет. В России наиболее активным потребителем маргариновой продукции является кондитерская отрасль (34 %), хлебопекарная (33 %) и молочная, в том числе производство мороженого (24 %). И это, несмотря на то, что уже в начале 80-х годов появились подозрения в том, что с маргарином далеко не всё в порядке.


Маргарин получают путём каталитической гидрогенизации дешёвых жидких растительных масел: хлопкового, льняного, соевого, подсолнечного, кукурузного. В качестве катализатора используют т.н. никель Ренея. Для его приготовления сплавляют алюминий с никелем. В то время, как алюминий растворяется в щёлочи, никель в ней нерастворим. При выщелачивании сплава образуется никелевая губка с огромной поверхностью. При повышенной температуре через смесь растительных жиров с никелем Ренея пропускается водород. Образуются твёрдые насыщенные жиры (маргарин), но в результате побочного процесса при этом происходит изомеризация цис-ненасыщенных кислот в транс-ненасыщенные кислоты.

К настоящему времени опубликовано большое число исследований, демонстрирующих связь между диетами с высоким содержанием трансжиров и коронарной болезнью. Потребление продуктов с высоким уровнем транс-изомеров может вызывать различные сердечно-сосудистые и онкологические заболевания, овуляционное бесплодие, болезнь Альцгеймера, риск коронарных заболеваний сердца в раннем возрасте. В частности было заявлено о 20 тыс. смертей ежегодно в США от потребления трансжиров. Сообщалось, что простая мера в виде уменьшения употребления трансжиров до 1 % в общей энергозатрате организма предупредит 11 000 случаев инфаркта миокарда и 7000 смертельных исходов только в Англии ежегодно (Removing industrial trans fat from foods // British Medical Journal 2010).  Администрация по контролю за продуктами питания и лекарствами США (FDA) с 1 января 2006 обязала всех производителей питания указывать на упаковке содержание транс-жиров в продукте питания, отдел здравоохранения Нью-Йорка рекомендовал 20000 ресторанам и 14000 поставщикам продуктов питания исключить использование и поставки частично гидрированных жиров, мотивируя их использовать продукты питания, не содержащие производимых промышленно транс-жиров.

В 2015 году в Соединенных Штатах были приняты меры по ограничению использования в производстве гидрогенизированных масел путем снятия с них квалификации "в целом признаны безопасными". В соответствии с постановлением FDA США, уже к июню 2018 года производители должны удалить транс-жиры из своей продукции. Все эти меры практически бесполезны по причине того, что рестораторы и продавцы готовой продукции получают большие прибыли от использования маргарина, в том числе большую сохранность продуктов питания и меньшие затраты на их приготовление. В статье (https://systemity.livejournal.com/2273920.html) приведено содержание транс-жиров в процентах от общего количества жиров в порции жареного картофеля, купленного в ресторанах "Макдоналдс" в разных странах (По данным, опубликованным в "New England Medic
al Journal", v. 354, p. 1650-1652, 2006.). В ЮАР в жареном картофеле содержится транс-жиров 28%, В Нью-Йорке - 23%, в Италии - 14, в России - 10, в Голландии 7, в Дании - 1%.

Все описанные мною в этом разделе факты современной наукой никак не объясняются, но они непосредственно вытекают из описанного мною сценария происхождения жизни на Земле.



systemity: (роза красная морда большая)
Происхождение жизни на Земле представляет  собой проблему №1 современного, и не только, естествознания. Всё, что на сегодня в этой области было создано, это - множество придуманных научных компартментов псевдознания, построенных на множестве отдельных фрагментов знания, которые как-то хотя бы отдаленно можно было бы привязать к феномену жизни. Например, клетки очень маленькие по размеру, напоминающие капельки эмульсии. Отсюда - фантазия на тему том, что живые клетки могли образоваться из капелек бульона, который, ксати говоря, никак не мог образовываться в океанах предбиологической Земли под жесточайшим УФ-излучением Солнца. Эта бессмысленная фантазия держится на плаву уже почти сто лет только потому, что из всех фантазий она кажется менее фантастичной. Да, капельки маленькие и клетки маленькие, но между ними нет и не может быть абсолютно ничего общего. Вообще ничего. Кроме верующих в загробный мир, никто не решится оспаривать общеизвестную истину, заключающуюся том, что живое может стать мёртвым, но мертвое не может воскреснуть в живое.

Read more... )



systemity: (роза красная морда большая)
Под давлением ментального вакууума в области происхождения жизни научный мир склоннен развлекаться кажущимися на первый взгляд научными идеями о возможности происхождения неуглеродной жизни на основе кремния, фосфора, бора, серы или любого другого элемента, способного образовывать структурно-сложные соединения. Происхождение жизни, мол, объяснить мы пока не можем, а вот эти вопросы обсуждать вполне можем, что в философии принято называть подменой понятий. Далее под влиянием этого ментального вакуума, фантазируют на тему того, что могло бы играть роль "кислорода", а что "водорода" для этой иной неуглеродной жизни. Всё это вызвано лишь неспособностью создать хоть сколько-нибудь правдоподобный сценарий происхождения углеродной жизни, основанный не на фантазии, не на чуде вероятной невероятности, а на процессах, вероятность которых может быть оценена с точки зрения конкретных химических взаимодействий, коррелирующих с тем, что сегодня науке известно об обмене веществ биологических объектов.

Read more... )



systemity: (роза красная морда большая)
Но вернёмся к процессу материализации тьмы, начало обсуждения которого было положено в предыдущем разделе 6.1. В этом разделе, который при желании с ним ознакомиться не вызовет больших затруднений у грамотного человека, я преследую две вполне конкретные цели. Одна из них - показать, что даже на самом верху научного Олимпа обитают высококвалифицированные исследователи, которые в некоторых компартментах мыслительной активности могут демонстрировать признаки полной несостоятельности. На эту тему очень точно сказано в записных книжках И. Ильфа: "Держали двадцать корректур, и всё равно на титульном листе было напечатано: "Британская энциклопудия". Моя цель - продемонстрировать, что, если неадекватных мыслителей можно встретить на самом верху научного Олимпа, то что уж говорить об обычных терапевтах, которые изо всех сил стараются выглядеть знающими, которые, как правило, мало читают и, в полном соответствии с тенденциями развития современной медицины, быстро теряют знания в области биохимии, полученные ими в процессе учёбы в высшем учебном заведении. Слепая вера в непроверенных врачей может привести к роковым последствиям и об этом никогда не стоит забывать.

Read more... )
systemity: (роза красная морда большая)

В одном очень старом чхословацкого производства кинофильме, название которого я не помню, алхимик на вопрос, чем он занимается, отвечает, что занимается "материализацией тьмы". В настоящее время можно констатировать глубокий ментальный вакуум в плане сколь-нибудь здравомысленного объяснения происхождения жизни на Земле. И нет лучшей характеристики деятельности огромного числа передовых учёных, занимающихся решением этой проблемы, чем "материализация тьмы".

Существует два альтернативных подхода к созданию видимого правдоподобия и респектабельности псевдонаучных идей, посвященных решению этой самой сложной из всех существующих проблем фундаментальной науки. Один из таких подходов заключается в придумывании некого функционально чрезвычайно сложного субъекта действия, доказательство существования которого по совершенно понятным причинам недостижимо, для того, чтобы с помощью этого чрезвычайно сложного объяснять реально существующее простое. Уловка заключается в том, что, поскольку это выдуманное и недоказуемое сложное хорошо "объясняет" простое, то доказательство реальной возможности существования этого сложного представляется не столь принципиально важным. Например, придумывается идея абсолютно невероятного спонтанного возникновения "умных" нуклеиновых кислот, которые вопреки всем канонам современной биологии и в полном соответствии с давно отвергнутой идеей витализма вдруг создали живую клетку. Далее следуют имитационные доказательства с помощью чисто научных манипуляций, непонятных никому кроме манипуляторов, квалификации которых нельзя не верить в силу их былых научных заслуг.

Read more... )




systemity: (Default)
Ученые: Жизнь на Земле возникла не в водном растворе




Жизнь на Земле возникла не в водном растворе, а в формамиде — производном муравьиной кислоты. К такому выводу пришли ученые Гарвардского университета, сообщается на сайте Phys.org.

Как отмечается, формамид не встречается в больших количествах в природе. Некоторое количество этого соединения могло находиться на падающих на Землю метеоритах и кометах, однако для появления жизни этого было мало. Ученые считают, что в некоторых местах на древней Земле формамид мог синтезироваться естественным образом в относительно больших объемах.

По данным исследователей, формамид способствует образованию длинных полимерных цепей в большей степени, чем вода, а также сам может вступать в химические реакции с образованием нуклеотидов, аминокислот и других важных для жизни соединений.





systemity: (Default)

Ученые раскрыли тайну возникновения жизни на Земле


Жизнь на Земле возникла благодаря потокам космической пыли, которые занесли на планету биологические молекулы или даже примитивные формы жизни. К такому выводу пришли ученые Эдинбургского университета, сообщается в пресс-релизе на сайте Phys.org.

Микроскопические живые организмы способны мигрировать с планеты на планету, когда пылевые потоки сталкиваются с внешними слоями атмосферы, установили ученые. Эксперименты на космическом аппарате «Фотон-М3» показали, что к подобным существам относятся тихоходки — крошечные членистоногие размером от 0,1 до 1,5 миллиметра. Некоторые тихоходки способны полностью восстанавливать свои жизненные функции и производить жизнеспособное потомство после пребывания в открытом космосе.

По расчетам исследователей, скорость потоков должна составлять 70 километров в секунду, чтобы частицы, находящиеся на высоте 150 километров над поверхностью, были выбиты за пределы гравитационного притяжения.




systemity: (Default)
Я - атеист со всеми интеллектуальными причиндалами, положенными настоящему атеисту. Атеист - это тот, который имеет мужество сказать себе: "Я этого пока не понимаю, а может быть и никогда в жизни не пойму, но в успокоительных сказках не нуждаюсь, самообманом не увлекаюсь!" Атеист имеет мужество так говорить себе вместо того, чтобы натягивать презерватив веры на незнание, рисовать на этом презервативе математические, химические, физические и просто философские формулы и знаки, после чего выстраиваться рядом в горделивой позе будущего нобелевского лауреата. Я всегда имею ввиду максиму Вольтера: "торжество разума заключается в том, чтобы жить в мире с теми, кто разума не имеет", потому что самым категорическим образом не приемлю эту максиму в науке, хотя неизменно следую ей в обычной жизни. Не исключено, что я сильно ошибаюсь, но не люблю я врать: всех известных мне авторов гипотез о зарождении жизни на Земле я считаю высокообразованными дебилами, дебилизм которых сильно осложнён самоуспокоительной верой в торжество абсолютно невероятной случайности.

Самопроизвольное возникновение жизни из ДНК, РНК, рибозимов, бульонов и тому подобный гомерический бред может быть только лишь продуктом научно-религиозной веры, что само по себе является вершиной интеллектуальной несуразности. Любая вера в отличие от уверенности покоится на фундаменте неверифицируемости. Учёным, придумывавшим гипотезы о происхождении жизни на Земле, казалось, что они так хорошо наукоподобно наврали, что сугубо религиозная природа их гипотез надёжно скрыта. Но в каждой из известных на сегодняшний день гипотез обязательно присутствует акт "непорочного зачатия", осуществлявшийся при полном отсутствии научных знаний. Ну хорошо, представим себе, что свершилось событие, которое не имеет абсолютно никакой вероятности. Ни малейшей. Образовалась, как говорится, сдуру, самопроизвольно очень умная ДНК. И что дальше? Все остальные многочисленные стадии образования первичной клетки тоже возникли на основе невероятной вероятности? То есть, мы имеем в итоге процесс, вероятность которого равна абсолютной невероятности в степени абсолютной невероятности в степени абсолютной невероятности в степе...



systemity: (Default)
В настоящее время отсутствуют сколь-либо осмысленные сценарии происхождения жизни. Опаринский бред про капельки жира, более наукообразный и поэтому ещё более бессмысленный бред про нуклеиновые кислоты и многие другие "интересные мысли" на фоне отсутствия какого-либо серьёзного присутствия в понимании проблемы - всё это не мешает огромной армии "учёных" поддерживать тлеющий огонь в камине псевдонауки о процессе происхождения жизни. Для многих это - единственный способ зарабатывать на хлеб, как, например, для тех, которые занимаются уже не одно десятилетие поисками разума во Вселенной. Для людей с понатасканными из интернета фрагментами псевдонаучного знания приведённая ниже информация вполне съедобна. Я не думаю, что эта информация предназначена для тех, у кого в порядке с мозгами и фундаментальным знанием.

Астрономы: Венера была обитаемой 3 млрд лет назад

12.22.2016

Вторая по удаленности от Солнца планета – Венера – 3 млрд лет назад имела условия, подходящие для возникновения и развития жизни. Об этом заявили американские ученые по итогам ряда исследований и анализа данных, полученных при помощи роботов и космических станций.

Как сообщили астрономы, миллиарды лет назад на Венере были огромные океаны, в которых обитали представители примитивных форм жизни. Вполне возможно, что они эволюционировали бы, но этого не получилось из-за парникового эффекта, возникшего из-за огромного количества углекислого газа в атмосфере.

Венера так разогрелась, что вся вода из ее океанов превратилась в пар и развеялась под действием солнечных ветров по космосу. Сегодня атмосфера планеты представляет собой непроглядное облако серной кислоты. Температура на поверхности Венеры достигает 450 градусов Цельсия.

Ранее уфологи после тщательного изучения фотографий планеты заявили, что на Венере есть несколько инопланетных колоний. По словам ученых-любителей, в разных частях планеты им удалось увидеть сооружения в виде больших домов из камня.

Эти смешные уфологи путают "была обитаемой" с "могла быть обитаемой". Но зная о том, что они не имеют ни малейшего понятия о том, что такое жизнь и как она могла возникнуть, к этим уфологам не может быть никаких претензий: каждый зарабатывает на жизнь тем, чем умеет




systemity: (Default)
(Фрагмент книги "Кафе Дилетант")

Намеренная агрессия, которую я демонстрирую, говоря о достижениях современной науки в области проблемы происхождения жизни, имеет методологическое обоснование, которое необходимо объяснить. С древнейших времён и по сей день диалог между верующими и атеистами был исключен. Персонально, на основе взаимных доверительных отношений вопросы веры и неверия можно спокойно обсуждать, но с точки зрения логики и методологии дискуссионная активность здесь фактически невозможна, на что в своё время указал И. Кант в виде невозможности доказательства как бытия Бога, так и его небытия.


Read more... )

(Продолжение следует)

Часть VI


systemity: (Default)
(Фрагмент книги "Кафе Дилетант")

Когда главами современных цивилизованных государств становятся выходцы из подворотни (к сожалению, такое случается), то это наносит огромный вред населению, которое под влиянием современных средств массовой информации теряет существенную долю здравого смысла и приобретает черты социо-политического дебилизма. Но подобный процесс всё же обладает чертами обратимости. После периодов сталинского, гитлеровского, маоцзедуновского и т.п. вождизма, когда население пораженных идиотизмом стран совершало действия, никак не укладывающиеся в сознании современного человека, люди довольно быстро возвращались на почву нормального мышления после войн, развала экономик, неэффективности рабского труда, ужаса массовых смертей невинных жертв. В науке ситуация несколько иная. В науке откровенная чушь обычно застревает очень надолго.


Read more... )
(Продолжение следует)

Часть V
Часть VII
systemity: (роза красная морда большая)
(Фрагмент книги "Кафе Дилетант")

Моя четвёртая опорная идея заключалась в том, что основной причиной совершенно бессмысленной деятельности по поиску жизни во Вселенной,  которой человечество занимается не одно десятилетие, явилась остро-патогенная, антинаучная выдумка о самопроизвольной эволюции самопроизвольно образованных макромолекул, похожих на биологические макромолекулы. Смысл этой моей громоздкой фразы сводится к тому, что жизнь могла зародиться только из одной клетки. Это в свою очередь означает, что все свойства живого в виде самого минимального их проявления были приобретены одной клеткой в процессе длительного преобразования вплоть до того момента, когда она сумела произвести свою копию, разделившись на две клетки, несущих в себе все свойства первоклетки. Такой сценарий практически исключает возможность повторения акта сотворения жизни не только на Земле, но и в области сотен килопарсеков Галактики.

Read more... )
(Продолжение следует)

Часть IV
Часть VI

Profile

systemity: (Default)
systemity

February 2023

S M T W T F S
   12 3 4
567891011
12131415161718
19202122232425
262728    

Syndicate

RSS Atom

Most Popular Tags

Page Summary

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 16th, 2025 08:58 am
Powered by Dreamwidth Studios