systemity: (Default)
[personal profile] systemity
Ученые американского аэрокосмического агентства NASA рассказали миру о сенсационном открытии, которое ведет к пересмотру самого понятия "жизни", "живого организма". Речь идет о найденной на дне соленого озера бактерии, для которой естественной средой обитания является ядовитая мышьячная среда.

Однако в Институте медико-биологических исследований (ИМБП) Российской академии наук называли представленное NASA открытие "очередным мыльным пузырем" и "надуманной сенсацией". "Я к заявлению NASA отношусь так, что это ни на чем не основывающееся преждевременное заключение. Никакого инопланетного характера в этой бактерии нет", - заявила "Интерфаксу" в пятницу заведующая лабораторией ИМБП Наталья Новикова.

"На Земле существуют самые разные бактерии, которые могут расти и развиваться в самых экстремальных условиях. Могут и цианистый калий утилизировать. Они разные, усваивают разные вещества. До сих пор существуют тысячи неоткрытых видов. А это всего лишь открытие нового вида бактерий", - считает она.

Глава научной лаборатории напомнила, что бактерии могут существовать на водных контурах ядерного реактора, где высокий уровень радиации, при значительных минусовых температурах в Антарктиде, по условиям близким к тем, что существуют на Марсе.

Она также напомнила об одной из предыдущих "сенсаций" NASA, когда в 1970-х годах американские ученые обнаружили на возвращаемой капсуле "Аполлона", вернувшегося с Луны, живую бактерию. В итоге оказалось, что это земной микроорганизм.

Странная в России наука, если заведующая лабораторией ни хрена не поняла. Не поняла, что бактерии, существующие в водных контурах ядерного реактора, при значительных минусовых температурах, утилизирующие цианистый калий состоят из тех же элементов ДНК, что и человек. 

Date: 2010-12-04 07:49 am (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Если в определенной нуклеотидной последовательности фосфор замещён на мышьяк, то сама последовательность остаётся идентичной той, которая была до замещения. Когда Вы меняете свои голубые кальсоны на светлобежевые, то об этом никто не догадается до тех пор, пока Вы не закинете ногу на ногу. Очень приятно иметь дело с грамотным эукариотом.

Date: 2010-12-04 08:01 am (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
"Если в определенной нуклеотидной последовательности фосфор замещён на мышьяк"
В чьей нуклеотидной последовательности? Бактерии из изестного семейства. Вот именно. О чём "дура" и говорит.

Date: 2010-12-04 08:18 am (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
"Дура" вместе с Вами, дорогой полуучёный, не понимает, что не может быть полупустого или полуполного. Небольшое замещение фосфора на мышьяк приводит к смерти организма. Почитайте Флобера. Кроме того, переход на мышьяк должен привести к целому ряду компенсаторных механизмов, связанных с метаболизмом серы и селена. Бактерии нельзя приучить к мышьяку, как пишут авторы открытия. Просто в осадке было небольшое количество бактерий с полным замещением фосфора на мышьяк, которые при пересеве всё более и более отделялись от "фосфорных" аналогов. Мышьяково-фосфорных форм не может быть просто потому, что быть не может. А отсюда - множество очень важных следствий, которые мне с Вами обсуждать не интересно в том числе и потому, что у нас второй час ночи пошёл.

Date: 2010-12-04 02:57 pm (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
"переход на мышьяк должен привести к целому ряду компенсаторных механизмов, связанных с метаболизмом серы и селена" Почему это не може произойти постепенно? Но это к слову.
А главное - кАк Вы объясняете появление мышьяковых бактерий? Одним скачком из фосфорных, типа бог из машины? Или откуда иначе у них знакомая последовательность нуклеотидов?

"Небольшое замещение фосфора на мышьяк приводит к смерти организма. "
Ой, что-то у меня закралось подозрение, что тут речь о том, чтобы взять некоторый организм и произвести в нём оное небольшое замещение.

Date: 2010-12-04 06:50 pm (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Видите ли, в чём дело. Я могу заблуждаться. Если я в этом смогу убедиться, то, во-первых, в этом признаюсь, а, во-вторых, извинюсь. Но я высказываю своё личное мнение, которое с большой вероятностью будет отличаться от мнения другого человека, обладающего индивидуальным взглядом на вещи. Реакция же тётки, которуя я назвал дурой, это - реакция типичного советского чиновника от науки. Хорошо: мыльный пузырь, так мыльный пузырь. Но даже мыльные пузыри непохожи друг на друга. Тётка же в своей реакции на новость не сказала ничего, что бы свидетельствовало о том, что у неё есть мнение по этому в общем-то нетривиальному поводу. Я уже более 17 лет вдали от страны, где человек - человеку друг, товарищ и брат. Но, как услышу знакомые обороты, начинает тошнить и хочется громко сказать: "Кишен тухес!" или "Кушен тохэс!" (как кому нравится). Я только что приехал. Через пол часа я отвечу на Ваши упрёки и подозрения.

Date: 2010-12-04 08:08 pm (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Вы же не можете одновременно есть суп и чистить зубы. Это, как дорожный знак, который одновременно показывает налево, направо и вперёд. В метаболизме нет независимых процессов, всё встроено в общую систему. Хотя мышьяк и является близким родственником фосфора, но ферменты, работающие на фосфорное соединение, не смогут делать то же самое, с арсеновым соединением. А даже малейшее изменение активности должно нарушить всю цепь согласованных процессов. Это - общие соображения, никто, насколько я знаю, не догадывался синтезировать пиридиновые нуклеотиды на мышьяке, аденозил триарсенат и т.д. и пробовать эти соединения на процессах ин витро.

Каждая более или менее выраженная таксономическая структура имеет, как правило, некое обобщающее свойство и свойство, связанное с той или иной экологической нишей обитания. Например, все Mycobacterium имеют миколовые кислоты, но длина алкильной цепи миколовых кислот отличается. Сапрофитные почвенные микобактерии имеют близкие значения длин, в то время, как микобактерии проказы, микобактерии бычьего и человечьего туберкулёза имеют свою общность и отличаются от миколовых кислот сапрофитных микобактерий. Т.е. экологическая ниша, а в особенности это касается экстремофилов, в существенной степени формирует физиологическое, биохимическое, соответственно, таксономическое сходство бактерий.

Я разработал теорию, согласно которой то, что мы называем жизнью, зародилось до появления нуклеиновых кислот, белков, желтков и пр. Матрицей будущей жизни послужила способность простейшей самоорганизующейся системы аккумулировать энергию внешней среды в виде первичного макроэрга - окиси магния. АТФ, как универсальная энергетическая валюта всего живого, явилась эволюционным усовершенствованием окиси магния. Окись магния включена в активную АТФ между вторым и третьим фосфатом, а АТФ-аза является эволюционным усовершенствованием механизма спонтанного синтеза окиси магния.

Как известно, окись магния взаимодействует с водой с возвратом в ион магния. В соответствии с высказанным мною мнением первым шагом на пути от окиси магния к АТФ, т.е. к защите окиси магния от гидролиза явилось взаимодействие первой с фосфатами, с пирофосфатом и полифосфатами. В дальнейшем для ограничения длины полифосфатов использовался аденозин.

Озеро Моно образовалось 750 тысяч лет назад и постоянно усыхает. Если в воде озера присутствовали одновременно значительные количества и фосфата, и арсената, то эволюция могла пойти параллельно: взаимодействие окиси магния с пирофосфатом и пироарсенатом, полифосфатами и полиарсенатами. В одинаковых условиях таким образом мог сформироваться, как фосфатный вариант, так и арсенатный вариант бактерии. Идентичные условия существования и сходство физико-химических свойств арсения и фосфора могли привести, соответственно, к возникновению параллельных видов.

Вопрос этот чрезвычайно интересен. У меня сейчас не очень много времени, но я начну следить за деталями публикаций об этом феномене.

Date: 2010-12-05 07:24 am (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
"никто, насколько я знаю, не догадывался синтезировать пиридиновые нуклеотиды на мышьяке, аденозил триарсенат и т.д. и пробовать эти соединения на процессах ин витро."
Скорее всего, это технически невозможно. Сами-то эти соединения могут выживать в водной среде достаточно времени для эксперимента?
Если всё-таки возможно - то зря, что не догадались, хотя насчёт вероятных результатов я Вашего мнения не оспариваю, просто тут белое пятно, не особо заманчивое, но бросающееся в глаза - надо закрасить и, скорее всего, забыть.
Да, а в качестве матрицы для полимераз, используемых при секвенировании, мышьяковая ДНК всё-таки годится?


"даже мыльные пузыри непохожи друг на друга. Тётка же в своей реакции на новость не сказала ничего, что бы свидетельствовало о том, что у неё есть мнение по этому в общем-то нетривиальному поводу."
Ну пусть не разбирается она в мышьяке. А рассуждала логично: замещение - ну бывает. Штука интересная и неожиданная, но ничего инопланетянского в этом нет.


Длина цепи, возможно, имеет функциональное значение (температура?). Но (очень слабым) аналогом Вашей версии было бы независимое появление миколовых кислот у эукариот или архей. Совпадение же, в случае "параллельной жизни", нуклеотидных последовательностей, используемых - при сегодняшних-то методах - для классификации, куда менее вероятно, а их функциональность существует лишь в контексте уже сложившейся жизни. Предположим, что мы имеем достоверно "параллельную жизнь" с теми же нуклеотидами. Случись при этом мало-мальская корреляция последовательностей (но достоверно не шумовая), это было бы сенсацией, потрясающей основы науки.

"Матрицей будущей жизни послужила способность простейшей самоорганизующейся системы аккумулировать энергию внешней среды в виде первичного макроэрга - окиси магния."
Матрица - это вообще-то насчёт информации, а не энергии. Если бы мы знали, как выглядели (химически) первые репликаторы - только тогда и имел бы смысл вопрос, откуда бралась энергия.

Date: 2010-12-05 08:17 am (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
"Скорее всего, это технически невозможно. Сами-то эти соединения могут выживать в водной среде достаточно времени для эксперимента?" Это очень устойчивые соединения.

"Ну пусть не разбирается она в мышьяке. А рассуждала логично: замещение - ну бывает". Не бывает, потому и дура. Инопланетянство не имеет к этому отношения.

Миколовые кислоты с различной длиной боковой цепи встречаются лишь у микобактерий, нокардий или коринебактерий. При чём здесь археи и эукариоты???!!! Длина боковой цепи не имеет никакого отношения к температуре.

Фосфорный и мышьяковый вариант могут быть близкими видами, но иметь отличные последовательности ДНК.

Здесь как раз и идёт речь о матрице, поскольку в процессе первичной аккумуляции энергетических шумов и была заключена вся информация о будущих живых существах. Вопреки идиотской лотерейной логике большинства исследователей в области origin of life никакого метаболизма вот так на голом месте возникнут не могло. Я не говорю уже о процессе синтеза АТФ и о совсем уж идиотских сказках про РНК-мир. Самопроизвольно мог возникнуть только процесс аккумуляции энергии, отсюда - АТФ, от АТФ - метаболизм. Далее - везде.

Date: 2010-12-04 03:31 pm (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
Почему Screened comment? У меня-то мой коммент должен быть виден. Я залогинен, что видно и в данном окне.

Date: 2010-12-04 06:37 pm (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Я не понимаю, что Вас беспокоит. Все Ваши комментарии доступны.

Date: 2010-12-05 07:15 am (UTC)
From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
Они были недоступны посторонним (что нормально), но в тот раз были недоступны и мне (что ненормально).

Date: 2010-12-05 07:19 am (UTC)
From: [identity profile] systemity.livejournal.com
Я не делал ничего, ничего не менял. М.б. это какие-то шутки от администрации LJ?

Profile

systemity: (Default)
systemity

February 2023

S M T W T F S
   12 3 4
567891011
12131415161718
19202122232425
262728    

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Mar. 14th, 2026 06:43 am
Powered by Dreamwidth Studios